Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms