Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms