Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Fam20bQ8VCS3 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms