Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms