Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms