Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Q3U6N9 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Q3U6N9 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms