Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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