Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Usp39Q3TIX9 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Usp39Q3TIX9 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Usp39Q3TIX9 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Usp39Q3TIX9 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Usp39Q3TIX9 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms