Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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