Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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