Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpl28P41105 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms