Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms