Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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