Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms