Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
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