Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms