Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Atg4aQ8C9S8 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Atg4aQ8C9S8 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Atg4aQ8C9S8 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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