Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms