Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms