Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Ccndbp1Q3TVC7 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.7 ms