Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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LtbrP50284 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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LtbrP50284 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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LtbrP50284 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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LtbrP50284 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LtbrP50284 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms