Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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