Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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P10404 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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P10404 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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P10404 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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P10404 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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P10404 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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P10404 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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P10404 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
P10404 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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