Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Phf11bB4XVQ1 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms