Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Spocd1B1ASB6 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms