Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Limd1Q9QXD8 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Limd1Q9QXD8 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Limd1Q9QXD8 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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