Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Usp29Q9ES63 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms