Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms