Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smg9Q9DB90 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Smg9Q9DB90 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Smg9Q9DB90 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smg9Q9DB90 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Smg9Q9DB90 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Smg9Q9DB90 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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Smg9Q9DB90 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Smg9Q9DB90 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Smg9Q9DB90 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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Smg9Q9DB90 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smg9Q9DB90 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smg9Q9DB90 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Smg9Q9DB90 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smg9Q9DB90 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Smg9Q9DB90 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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