Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms