Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Hdac9Q99N13 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Hdac9Q99N13 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Hdac9Q99N13 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hdac9Q99N13 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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