Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Atg4aQ8C9S8 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Atg4aQ8C9S8 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Atg4aQ8C9S8 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Atg4aQ8C9S8 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Atg4aQ8C9S8 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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