Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NischQ80TM9 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NischQ80TM9 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms