Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms