Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Sft2d1Q5SSN7 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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