Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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