Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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