Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms