Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms