Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
VdrP48281 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
VdrP48281 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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VdrP48281 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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