Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms