Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms