Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RxraP28700 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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