Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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