Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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PtpraP18052 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PtpraP18052 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpraP18052 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpraP18052 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpraP18052 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpraP18052 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpraP18052 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpraP18052 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpraP18052 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpraP18052 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpraP18052 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms