Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
P10404 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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