Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms