Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc6D3YZP9 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms