Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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