Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rtf1A2AQ19 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms